Járványügyi tipizálás makrorestrikciós profil meghatározásával - PFGE vizsgálattal
Közösségben szerzett vagy kórházi fertőzésekből, valamint a kórházi környezetből esethalmozódás, járvány esetén kitenyésztett baktérium törzsek járványügyi vizsgálata. A klinikailag összefüggő esetek (legalább kettő) közötti járványügyi összefüggés igazolása vagy kizárása (terjedés betegről betegre, betegből környezetre, majd újabb betegre).
A makrorestrikciós fragmentumok számának és méretének meghatározása. A kapott mintázat alapján meghatározott típusról, altípusról (PFGE típus, altípus) a beküldőt, valamint ha ettől különböző, az illetékes járványügyi szakembert leletben tájékoztatjuk <Csoportos mikrobiológiai lelet PFGE alapú járványügyi tipizáló vizsgálatokhoz> mintán.
A vizsgálat elve a baktériumok teljes kromoszóma állományának enzimatikus feldarabolása (makrorestrikció), a keletkezett termékek (makrorestrikciós fragmentumok) molekulasúly szerinti szétválasztása pulzáló mezejű gélelektroforézissel (PFGE), majd detektálásuk ethidium-bromiddal való jelölés után (UV fényben láthatóvá válik a jelölt DNS). A kapott termékek száma és mérete egy mintázatot határoz meg (PFGE mintázat), amelyet szem ellenőrzése mellett szoftver segítségével értékelünk és tárolunk.
Makrorestrikció, makrorestrikciós fragmentum: a teljes bakteriális kromoszóma állomány hasítása DNS hasító enzimekkel (restrikciós endonukleázokkal), amelyek közül PFGE vizsgálatot megelőzően ritkán hasító enzimet használunk, hogy 10-30 kromoszóma darab (fragmentum) keletkezzen.
A vizsgálat eredményét, annak értékelését bemutató ábra:
a Képek menüpont alatt található. |